Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI2P48788 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI2P48788 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms