Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP1P48552 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms