Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XCR1P46094 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XCR1P46094 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XCR1P46094 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XCR1P46094 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
XCR1P46094 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XCR1P46094 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XCR1P46094 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XCR1P46094 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XCR1P46094 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XCR1P46094 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XCR1P46094 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms