Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MMP13P45452 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MMP13P45452 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MMP13P45452 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MMP13P45452 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MMP13P45452 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MMP13P45452 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP13P45452 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP13P45452 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP13P45452 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP13P45452 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP13P45452 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP13P45452 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP13P45452 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP13P45452 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP13P45452 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP13P45452 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP13P45452 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP13P45452 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP13P45452 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP13P45452 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP13P45452 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP13P45452 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MMP13P45452 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MMP13P45452 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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