Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCAMP43121 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCAMP43121 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCAMP43121 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCAMP43121 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCAMP43121 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCAMP43121 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCAMP43121 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCAMP43121 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCAMP43121 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCAMP43121 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCAMP43121 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCAMP43121 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCAMP43121 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCAMP43121 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCAMP43121 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCAMP43121 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCAMP43121 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCAMP43121 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCAMP43121 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCAMP43121 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCAMP43121 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCAMP43121 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCAMP43121 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCAMP43121 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCAMP43121 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCAMP43121 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCAMP43121 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MCAMP43121 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCAMP43121 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCAMP43121 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCAMP43121 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCAMP43121 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MCAMP43121 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCAMP43121 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCAMP43121 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCAMP43121 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCAMP43121 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCAMP43121 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MCAMP43121 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCAMP43121 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MCAMP43121 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCAMP43121 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCAMP43121 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCAMP43121 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCAMP43121 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCAMP43121 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCAMP43121 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCAMP43121 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCAMP43121 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCAMP43121 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCAMP43121 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCAMP43121 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MCAMP43121 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MCAMP43121 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MCAMP43121 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCAMP43121 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCAMP43121 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCAMP43121 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCAMP43121 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCAMP43121 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MCAMP43121 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCAMP43121 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCAMP43121 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCAMP43121 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MCAMP43121 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCAMP43121 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms