Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX1P40424 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PBX1P40424 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PBX1P40424 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PBX1P40424 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PBX1P40424 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PBX1P40424 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX1P40424 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX1P40424 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX1P40424 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX1P40424 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX1P40424 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PBX1P40424 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PBX1P40424 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX1P40424 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX1P40424 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX1P40424 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX1P40424 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX1P40424 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX1P40424 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX1P40424 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX1P40424 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX1P40424 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PBX1P40424 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PBX1P40424 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX1P40424 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX1P40424 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX1P40424 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX1P40424 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX1P40424 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX1P40424 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX1P40424 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX1P40424 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX1P40424 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX1P40424 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms