Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms