Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARGP37231 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARGP37231 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARGP37231 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARGP37231 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARGP37231 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARGP37231 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARGP37231 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PPARGP37231 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARGP37231 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARGP37231 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARGP37231 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARGP37231 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARGP37231 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPARGP37231 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGP37231 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGP37231 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGP37231 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGP37231 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGP37231 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGP37231 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGP37231 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGP37231 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGP37231 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGP37231 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGP37231 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGP37231 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGP37231 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGP37231 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGP37231 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGP37231 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGP37231 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGP37231 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGP37231 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGP37231 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGP37231 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms