Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms