Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms