Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP1P32455 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP1P32455 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP1P32455 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP1P32455 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP1P32455 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP1P32455 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP1P32455 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP1P32455 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP1P32455 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP1P32455 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GBP1P32455 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP1P32455 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP1P32455 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP1P32455 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP1P32455 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP1P32455 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP1P32455 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP1P32455 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP1P32455 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP1P32455 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP1P32455 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms