Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCKARP32238 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCKARP32238 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCKARP32238 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCKARP32238 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCKARP32238 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCKARP32238 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKARP32238 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKARP32238 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKARP32238 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKARP32238 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKARP32238 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms