Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms