Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE4AP27815 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4AP27815 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms