Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms