Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms