Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms