Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.4 ms