Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB5AP20339 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms