Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB3BP20337 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB3BP20337 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB3BP20337 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB3BP20337 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB3BP20337 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB3BP20337 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB3BP20337 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB3BP20337 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB3BP20337 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB3BP20337 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB3BP20337 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB3BP20337 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms