Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A1P19634 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms