Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD58P19256 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD58P19256 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD58P19256 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD58P19256 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD58P19256 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD58P19256 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD58P19256 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD58P19256 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD58P19256 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD58P19256 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD58P19256 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms