Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT4P19013 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT4P19013 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT4P19013 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT4P19013 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT4P19013 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT4P19013 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT4P19013 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT4P19013 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT4P19013 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT4P19013 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT4P19013 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT4P19013 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT4P19013 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT4P19013 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT4P19013 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT4P19013 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT4P19013 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT4P19013 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT4P19013 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT4P19013 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT4P19013 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT4P19013 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT4P19013 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT4P19013 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT4P19013 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT4P19013 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT4P19013 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT4P19013 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT4P19013 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT4P19013 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms