Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB3P16520 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB3P16520 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB3P16520 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB3P16520 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB3P16520 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB3P16520 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB3P16520 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB3P16520 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GNB3P16520 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GNB3P16520 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB3P16520 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB3P16520 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB3P16520 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB3P16520 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB3P16520 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB3P16520 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms