Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB4P16144 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms