Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms