Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2F2P13984 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms