Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL6A2P12110 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms