Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COX6A1P12074 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COX6A1P12074 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms