Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
VPREB1P12018 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms