Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETSIPP0DME0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETSIPP0DME0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms