Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGA3P0DJD8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms