Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF853P0CG23 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZNF853P0CG23 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms