Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L7P0C7H9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms