Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VIL1P09327 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VIL1P09327 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VIL1P09327 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VIL1P09327 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VIL1P09327 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VIL1P09327 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VIL1P09327 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VIL1P09327 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VIL1P09327 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VIL1P09327 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VIL1P09327 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VIL1P09327 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VIL1P09327 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VIL1P09327 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VIL1P09327 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VIL1P09327 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VIL1P09327 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VIL1P09327 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VIL1P09327 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VIL1P09327 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VIL1P09327 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VIL1P09327 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VIL1P09327 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VIL1P09327 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VIL1P09327 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VIL1P09327 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VIL1P09327 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VIL1P09327 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VIL1P09327 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VIL1P09327 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VIL1P09327 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VIL1P09327 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VIL1P09327 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VIL1P09327 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VIL1P09327 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms