Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI1P08151 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI1P08151 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI1P08151 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI1P08151 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI1P08151 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI1P08151 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI1P08151 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI1P08151 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI1P08151 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI1P08151 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI1P08151 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI1P08151 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI1P08151 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI1P08151 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI1P08151 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI1P08151 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI1P08151 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI1P08151 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI1P08151 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI1P08151 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI1P08151 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI1P08151 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI1P08151 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI1P08151 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI1P08151 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI1P08151 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI1P08151 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI1P08151 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI1P08151 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI1P08151 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI1P08151 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI1P08151 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GLI1P08151 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GLI1P08151 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GLI1P08151 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GLI1P08151 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI1P08151 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI1P08151 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI1P08151 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI1P08151 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI1P08151 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI1P08151 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI1P08151 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI1P08151 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI1P08151 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI1P08151 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI1P08151 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI1P08151 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI1P08151 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI1P08151 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI1P08151 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI1P08151 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI1P08151 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI1P08151 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI1P08151 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI1P08151 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI1P08151 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms