Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCNP04198 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCNP04198 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCNP04198 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCNP04198 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYCNP04198 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYCNP04198 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYCNP04198 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYCNP04198 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYCNP04198 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYCNP04198 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYCNP04198 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYCNP04198 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYCNP04198 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYCNP04198 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYCNP04198 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCNP04198 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms