Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD3O95983 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD3O95983 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD3O95983 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD3O95983 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD3O95983 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD3O95983 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD3O95983 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD3O95983 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD3O95983 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD3O95983 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD3O95983 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD3O95983 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD3O95983 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD3O95983 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD3O95983 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD3O95983 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD3O95983 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD3O95983 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD3O95983 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD3O95983 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD3O95983 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD3O95983 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD3O95983 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD3O95983 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MBD3O95983 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms