Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
STAMBPO95630 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms