Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM13AO94988 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM13AO94988 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms