Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF40AO75400 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms