Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45BO75293 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms