Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA3O75145 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms