Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC42.6■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC42.59■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
ABCC9O60706 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC42.54■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
ABCC9O60706 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC42.51■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms