Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMFO60524 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMFO60524 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMFO60524 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEMFO60524 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEMFO60524 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEMFO60524 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEMFO60524 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEMFO60524 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMFO60524 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMFO60524 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMFO60524 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms