Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms