Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP9O43818 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP9O43818 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRP9O43818 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRP9O43818 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP9O43818 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP9O43818 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP9O43818 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP9O43818 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP9O43818 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP9O43818 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP9O43818 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP9O43818 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP9O43818 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP9O43818 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP9O43818 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP9O43818 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP9O43818 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP9O43818 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP9O43818 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP9O43818 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP9O43818 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP9O43818 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP9O43818 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP9O43818 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP9O43818 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP9O43818 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP9O43818 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP9O43818 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP9O43818 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP9O43818 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP9O43818 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP9O43818 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP9O43818 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP9O43818 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms