Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms