Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCXO43602 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCXO43602 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCXO43602 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCXO43602 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCXO43602 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCXO43602 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCXO43602 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCXO43602 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DCXO43602 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCXO43602 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCXO43602 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 357.7 ms