Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP290O15078 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP290O15078 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP290O15078 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP290O15078 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP290O15078 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP290O15078 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP290O15078 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP290O15078 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP290O15078 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP290O15078 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP290O15078 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP290O15078 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP290O15078 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP290O15078 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP290O15078 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP290O15078 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP290O15078 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP290O15078 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP290O15078 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP290O15078 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP290O15078 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP290O15078 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CEP290O15078 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CEP290O15078 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP290O15078 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP290O15078 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP290O15078 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP290O15078 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP290O15078 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP290O15078 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP290O15078 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP290O15078 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP290O15078 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP290O15078 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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